SBDD(Structure-Based Drug Design)已被醫藥品業界持續使用25年以上。SBDD在藥物發明、設計、以及最佳化的領域中,持續扮演重要角色。更進一步,隨著高等生物物理學與計算處理方法之發展,SBDD對於靶物(hit)的確認,以及從靶物到前導 (hit to lead)化合物的最佳化方法,造成全體業界重大之影響。本次的議程之中,將焦點置於SBDD用於醫藥品化學、計算處理、生物物理學上之成功案例與最新發現。主辦單位在此邀請各界,針對下列領域中之最新發現(尚未發表),出席會議進行研究發表。
- 各種案例學習:醫藥品化學家與模型專家共同談論「在確認與發展靶物與前導化合物之候補時,SBDD所扮演之角色」
- 「Med Chem」之展望: 多重特性之最佳化,及其與SBDD相似之角色
- 化合物的物理化學特性、ADME特性之考察(ERG、以X光構造為基礎之CYP例子)
- 活體外(in vitro)與活體內(in vivo)化合物之藥理學特性之考察
- 化合物之設計:化學與生物學之結合
- 計算處理方法:
- 新計算處理方法與其利用: ab initio/QM的虛擬篩選、蛋白質柔軟性之處理、同性模型、QSAR等
- 虛擬篩選與虛擬對位(docking)
-片段(fragment-based)篩選與DeNovo設計方法
- pharmacophore模型
- 蛋白質與配體(ligand)之相互反應
- 配體與標的之親和性預測:自由能之計算・MM/PBSA・評分函數(scoring function)機能等
- implicit/explicit water模型之溶媒與效果
- 共有鍵結型抑制劑能帶來什麼新意?
- 蛋白質再重組能量與配體應變計算
- 鍵結site水分子之角色
- 前導化合物最佳化中,explicit water資訊之利用
- 水對鍵結特異性之影響
- 將運動學資料使用於結構模型
- k_on以及k_off之重要性:調整 k_on或k_off來促進效力
- 運動行為之計算模擬
- 生物物理學方法之應用
- 蛋白質-配體、蛋白質-蛋白質複合體之構造確認: X光結晶・NMR
- 蛋白質與配體親和性之判斷: MS・SPR・NMR・ITC
- 新標的領域: 批準・可藥性(drugability)
- SBDD的新方向: 膜結合性蛋白質・離子通道・GPCR